Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6P3

RAB44, Ras-related protein Rab-44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB44Q7Z6P3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB44Q7Z6P3 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms