Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms