Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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IFT88Q13099 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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IFT88Q13099 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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IFT88Q13099 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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IFT88Q13099 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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IFT88Q13099 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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IFT88Q13099 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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IFT88Q13099 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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IFT88Q13099 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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IFT88Q13099 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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