Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
GCSHP23434 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
GCSHP23434 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
GCSHP23434 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
GCSHP23434 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
GCSHP23434 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
GCSHP23434 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
GCSHP23434 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GCSHP23434 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
GCSHP23434 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
GCSHP23434 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
GCSHP23434 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GCSHP23434 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GCSHP23434 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
GCSHP23434 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
GCSHP23434 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GCSHP23434 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GCSHP23434 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GCSHP23434 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GCSHP23434 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GCSHP23434 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
GCSHP23434 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GCSHP23434 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
GCSHP23434 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
GCSHP23434 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GCSHP23434 RAB3IP-212ENST00000550536 9646 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GCSHP23434 FBXO22-201ENST00000308275 10725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GCSHP23434 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GCSHP23434 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GCSHP23434 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GCSHP23434 GREB1-201ENST00000234142 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GCSHP23434 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
GCSHP23434 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
GCSHP23434 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GCSHP23434 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GCSHP23434 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
GCSHP23434 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 ARHGEF10-205ENST00000518288 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 PLEKHG3-201ENST00000247226 10351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GCSHP23434 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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