Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms