Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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