Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 RALGPS2-203ENST00000367634 7512 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 LINC01973-201ENST00000374983 4678 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 NTRK2-208ENST00000395882 7111 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 KIF14-201ENST00000367350 7274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 SLC44A1-201ENST00000374720 10511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 PRRG4-201ENST00000257836 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 SLC26A2-201ENST00000286298 8080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 MTHFR-203ENST00000376585 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 RNF125-201ENST00000217740 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 CEP68-201ENST00000260569 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 RYR1-202ENST00000359596 15117 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 GPRASP1-201ENST00000361600 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 NEXMIF-201ENST00000055682 11719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 ZNF142-205ENST00000449707 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms