Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DENRO43583 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
DENRO43583 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
DENRO43583 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DENRO43583 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DENRO43583 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DENRO43583 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DENRO43583 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DENRO43583 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DENRO43583 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DENRO43583 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DENRO43583 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DENRO43583 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DENRO43583 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DENRO43583 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DENRO43583 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DENRO43583 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DENRO43583 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DENRO43583 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DENRO43583 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DENRO43583 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DENRO43583 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DENRO43583 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DENRO43583 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DENRO43583 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DENRO43583 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DENRO43583 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DENRO43583 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DENRO43583 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DENRO43583 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DENRO43583 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DENRO43583 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DENRO43583 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DENRO43583 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DENRO43583 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DENRO43583 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DENRO43583 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DENRO43583 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DENRO43583 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DENRO43583 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DENRO43583 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DENRO43583 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DENRO43583 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DENRO43583 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DENRO43583 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DENRO43583 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DENRO43583 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DENRO43583 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DENRO43583 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DENRO43583 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DENRO43583 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DENRO43583 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DENRO43583 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms