Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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