Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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