Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms