Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-CQ95604 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-CQ95604 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-CQ95604 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-CQ95604 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-CQ95604 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-CQ95604 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-CQ95604 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-CQ95604 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-CQ95604 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-CQ95604 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 FAM9B-203ENST00000428477 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms