Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms