Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z460

CLASP1, CLIP-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASP1Q7Z460 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLASP1Q7Z460 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms