Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 334.7 ms