Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 GTF2IP13-202ENST00000609439 10247 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 MADD-204ENST00000395336 5942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 ERVK13-1-205ENST00000568395 5578 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC007614.5-201ENST00000623424 8892 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
USF2Q15853 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
USF2Q15853 SNIP1-201ENST00000296215 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
USF2Q15853 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
USF2Q15853 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
USF2Q15853 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
USF2Q15853 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
USF2Q15853 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
USF2Q15853 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
USF2Q15853 PDE2A-201ENST00000334456 4315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
USF2Q15853 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
USF2Q15853 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
USF2Q15853 HECW1-201ENST00000395891 9501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
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