Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms