Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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IKZF1Q13422 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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