Protein–RNA interactions for Protein: Q12894

IFRD2, Interferon-related developmental regulator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD2Q12894 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFRD2Q12894 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 318.7 ms