Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 NUCB1-209ENST00000465524 839 ntTSL 514.63□□□□□ -0.076e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 EEF1D-229ENST00000530109 533 ntTSL 214.59□□□□□ -0.076e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 DDB1-216ENST00000539739 1624 ntTSL 514.55□□□□□ -0.086e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 UTP4-213ENST00000568448 562 ntTSL 414.52□□□□□ -0.096e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 EIF4G2-228ENST00000534246 523 ntTSL 214.44□□□□□ -0.16e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 DDB1-218ENST00000540784 1119 ntTSL 314.38□□□□□ -0.116e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 LMBR1-206ENST00000430825 1208 ntTSL 514.28□□□□□ -0.126e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.136e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 GTPBP2-203ENST00000419497 1394 ntTSL 214.09□□□□□ -0.156e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 GLUL-204ENST00000417584 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.176e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.176e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.186e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.79□□□□□ -0.26e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 NUCB1-211ENST00000485798 938 ntTSL 313.53□□□□□ -0.246e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 AGPAT1-207ENST00000476663 746 ntTSL 513.49□□□□□ -0.256e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 TSEN54-206ENST00000579449 786 ntTSL 213.41□□□□□ -0.266e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 AGPAT1-204ENST00000395496 2103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.276e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 SHANK2-201ENST00000338508 7271 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.286e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 AC068896.1-201ENST00000494792 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.296e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.36e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.316e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 GTPBP2-204ENST00000432918 1850 ntTSL 313.05□□□□□ -0.326e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 AGPAT1-206ENST00000395499 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.356e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 TSEN54-203ENST00000545228 1139 ntTSL 512.81□□□□□ -0.366e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 GTPBP2-201ENST00000307114 2830 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.366e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.386e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 COX19-201ENST00000344111 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.396e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 COQ9-205ENST00000563391 713 ntTSL 512.46□□□□□ -0.412e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 COQ9-204ENST00000563166 399 ntTSL 512.37□□□□□ -0.432e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 EIF4G2-210ENST00000527419 571 ntTSL 512.17□□□□□ -0.466e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 EIF4G2-211ENST00000527526 555 ntTSL 412.11□□□□□ -0.476e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 MRPL2-205ENST00000480286 661 ntTSL 212.08□□□□□ -0.486e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.486e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 DDB1-209ENST00000537877 1375 ntTSL 211.98□□□□□ -0.496e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 CDK2AP1-204ENST00000538446 1161 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.56e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 GTPBP2-208ENST00000476510 2816 ntTSL 511.81□□□□□ -0.526e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 SHANK2-206ENST00000424924 6821 ntTSL 511.8□□□□□ -0.526e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 SMARCD2-205ENST00000577686 394 ntTSL 311.75□□□□□ -0.536e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 SQSTM1-208ENST00000485412 656 ntTSL 211.64□□□□□ -0.556e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 TIMM21-206ENST00000584925 590 ntTSL 211.62□□□□□ -0.556e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 DDB1-207ENST00000535967 1404 ntTSL 311.6□□□□□ -0.556e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 UTP4-214ENST00000569014 568 ntTSL 411.46□□□□□ -0.576e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 PGM1-201ENST00000371083 2657 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.596e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 E2F6-207ENST00000455198 2227 ntTSL 1 (best)11.3□□□□□ -0.66e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 ATP7B-207ENST00000466629 463 ntTSL 211.29□□□□□ -0.66e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 KIF1B-212ENST00000622724 8588 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.616e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 DDB1-204ENST00000535147 2789 ntTSL 211.17□□□□□ -0.626e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 TIMM21-203ENST00000579071 821 ntTSL 211.11□□□□□ -0.636e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 TNS2-213ENST00000550660 664 ntTSL 211.06□□□□□ -0.646e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 KIF1B-213ENST00000635499 2098 ntTSL 510.91□□□□□ -0.666e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 SHANK2-205ENST00000412252 1376 ntTSL 510.9□□□□□ -0.676e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 EIF4G2-214ENST00000530211 591 ntTSL 210.77□□□□□ -0.696e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 AGPAT1-208ENST00000490711 2448 ntTSL 210.67□□□□□ -0.76e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 TOP3A-215ENST00000583328 727 ntTSL 210.64□□□□□ -0.716e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 EIF4G2-216ENST00000530702 563 ntTSL 210.39□□□□□ -0.756e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 UTP4-208ENST00000567015 690 ntTSL 210.39□□□□□ -0.756e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 GLUL-212ENST00000491322 6132 ntTSL 1 (best)10.39□□□□□ -0.756e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 EIF4G2-221ENST00000532082 1069 ntTSL 1 (best)10.19□□□□□ -0.786e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 DDB1-202ENST00000414411 1904 ntTSL 210.11□□□□□ -0.796e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 SLC3A2-217ENST00000541425 595 ntTSL 510.07□□□□□ -0.86e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 UTP4-202ENST00000352319 1841 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.86e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 KIF1B-211ENST00000620295 8624 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.826e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 UTP4-207ENST00000566227 747 ntTSL 39.91□□□□□ -0.826e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 MYO19-202ENST00000610576 569 ntTSL 39.64□□□□□ -0.876e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 DDB1-211ENST00000538280 227 ntTSL 39.56□□□□□ -0.886e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 NUCB1-208ENST00000460125 528 ntTSL 29.52□□□□□ -0.896e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 ERBB2-207ENST00000578502 497 ntTSL 59.49□□□□□ -0.896e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 BRD4-204ENST00000594066 587 ntTSL 39.27□□□□□ -0.936e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 E2F6-209ENST00000471343 970 ntTSL 29.21□□□□□ -0.946e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 DDB1-225ENST00000545930 1278 ntTSL 29.18□□□□□ -0.946e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 GLUL-207ENST00000463851 939 ntTSL 39.13□□□□□ -0.956e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 SLC3A2-207ENST00000535768 597 ntTSL 59.08□□□□□ -0.966e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 CDK2AP1-206ENST00000544658 931 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.976e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 ACSS2-223ENST00000494727 1030 ntTSL 28.93□□□□□ -0.983e-14■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 KIF1B-202ENST00000377081 8746 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.996e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 MYO19-224ENST00000620943 654 ntTSL 28.75□□□□□ -1.016e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 EIF4G2-219ENST00000531507 591 ntTSL 58.46□□□□□ -1.066e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 TNS2-212ENST00000550048 521 ntTSL 38.41□□□□□ -1.066e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 CEP95-211ENST00000580285 2681 ntTSL 58.35□□□□□ -1.076e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 TIMM21-204ENST00000580087 2524 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.086e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 CENPV-202ENST00000472570 554 ntTSL 28.27□□□□□ -1.096e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 GLUL-211ENST00000489818 683 ntTSL 38.27□□□□□ -1.096e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 SMARCD2-208ENST00000580054 477 ntTSL 58.2□□□□□ -1.16e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 TIMM21-202ENST00000577952 858 ntTSL 58.1□□□□□ -1.116e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 UTP4-206ENST00000564408 553 ntTSL 38.06□□□□□ -1.126e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 KIF1B-201ENST00000263934 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.136e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 EIF4G2-226ENST00000532570 573 ntTSL 57.95□□□□□ -1.146e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 SHANK2-208ENST00000426687 460 ntTSL 57.84□□□□□ -1.156e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 DNAJC11-208ENST00000469318 355 ntTSL 1 (best)7.76□□□□□ -1.176e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 GLUL-208ENST00000475808 868 ntTSL 27.69□□□□□ -1.186e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.26e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.236e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 GLUL-206ENST00000462444 793 ntTSL 27.31□□□□□ -1.246e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 GLUL-209ENST00000480604 908 ntTSL 57.31□□□□□ -1.246e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 EIF4G2-212ENST00000528562 601 ntTSL 47.27□□□□□ -1.256e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 UTP4-205ENST00000563299 581 ntTSL 37.01□□□□□ -1.296e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 GTPBP2-210ENST00000496137 516 ntTSL 36.89□□□□□ -1.316e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.346e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 EIF4G2-227ENST00000533485 806 ntTSL 26.57□□□□□ -1.366e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 TMEM234-212ENST00000495091 379 ntTSL 56.2□□□□□ -1.426e-6■□□□□ 10.9
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