Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms