Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AQP4P55087 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AQP4P55087 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AQP4P55087 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AQP4P55087 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AQP4P55087 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AQP4P55087 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AQP4P55087 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AQP4P55087 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AQP4P55087 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AQP4P55087 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AQP4P55087 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
AQP4P55087 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
AQP4P55087 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
AQP4P55087 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
AQP4P55087 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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AQP4P55087 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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AQP4P55087 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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AQP4P55087 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AQP4P55087 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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AQP4P55087 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AQP4P55087 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AQP4P55087 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AQP4P55087 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AQP4P55087 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AQP4P55087 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AQP4P55087 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AQP4P55087 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AQP4P55087 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AQP4P55087 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AQP4P55087 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AQP4P55087 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AQP4P55087 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AQP4P55087 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
AQP4P55087 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AQP4P55087 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AQP4P55087 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AQP4P55087 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
AQP4P55087 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AQP4P55087 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AQP4P55087 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AQP4P55087 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AQP4P55087 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AQP4P55087 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AQP4P55087 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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