Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms