Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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