Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms