Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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