Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms