Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L3Q6VB84 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms