Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms