Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4L6Q3SYB3 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FOXD4L6Q3SYB3 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms