Protein–RNA interactions for Protein: Q17RQ9

NKPD1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKPD1Q17RQ9 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NKPD1Q17RQ9 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms