Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 PLEKHG2-203ENST00000425673 8132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 CACUL1-201ENST00000369151 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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