Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms