Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms