Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 MBP-207ENST00000397865 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 ERBB2-203ENST00000445658 3238 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 PLA2G6-203ENST00000402064 3011 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 ABI1-203ENST00000376137 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 MED29-207ENST00000615911 3565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 CDRT4-204ENST00000619038 2498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 ZNF674-201ENST00000414387 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 CD36-207ENST00000432207 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 SHC1-210ENST00000448116 3481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 AL162727.1-201ENST00000437712 3043 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 RFX5-215ENST00000452671 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 TADA2B-205ENST00000515646 3818 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 ZNF621-201ENST00000310898 2404 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 KRI1-201ENST00000312962 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 TUFT1-202ENST00000368848 3033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 HECTD3-201ENST00000372168 2530 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 TTLL13P-206ENST00000641754 2256 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 ZSCAN21-201ENST00000292450 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 MYL9-201ENST00000279022 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 TUT1-202ENST00000308436 2826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 STAC2-201ENST00000333461 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 NBN-201ENST00000265433 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 ENOSF1-203ENST00000383578 4188 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 CDKN2B-201ENST00000276925 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 SLC38A1-202ENST00000439706 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 AC133065.6-201ENST00000625054 2378 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 PLEKHG2-203ENST00000425673 8132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 GDPD2-201ENST00000374382 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 SRRM4-201ENST00000267260 8477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms