Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA3Q08378 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms