Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms