Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms