Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms