Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ZC2HC1AQ96GY0 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms