Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00526Q96FQ7 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00526Q96FQ7 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00526Q96FQ7 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00526Q96FQ7 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00526Q96FQ7 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00526Q96FQ7 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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LINC00526Q96FQ7 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00526Q96FQ7 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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LINC00526Q96FQ7 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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LINC00526Q96FQ7 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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LINC00526Q96FQ7 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LINC00526Q96FQ7 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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LINC00526Q96FQ7 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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LINC00526Q96FQ7 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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