Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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ZNF548Q8NEK5 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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ZNF548Q8NEK5 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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ZNF548Q8NEK5 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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