Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms