Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms