Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 PAX6-238ENST00000638755 1161 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00449-201ENST00000366259 872 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 CRCT1-201ENST00000368790 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 MIR181D-201ENST00000384853 137 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms