Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHQ16836 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHQ16836 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHQ16836 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHQ16836 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHQ16836 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHQ16836 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHQ16836 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHQ16836 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHQ16836 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHQ16836 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHQ16836 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHQ16836 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHQ16836 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHQ16836 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHQ16836 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHQ16836 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHQ16836 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHQ16836 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHQ16836 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHQ16836 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHQ16836 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHQ16836 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHQ16836 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHQ16836 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHQ16836 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHQ16836 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHQ16836 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHQ16836 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHQ16836 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHQ16836 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHQ16836 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHQ16836 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHQ16836 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHQ16836 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHQ16836 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHQ16836 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHQ16836 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHQ16836 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHQ16836 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHQ16836 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHQ16836 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHQ16836 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHQ16836 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHQ16836 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHQ16836 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHQ16836 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHQ16836 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHQ16836 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHQ16836 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHQ16836 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHQ16836 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHQ16836 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHQ16836 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHQ16836 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms