Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
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PTPRKQ15262 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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PTPRKQ15262 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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PTPRKQ15262 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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PTPRKQ15262 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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PTPRKQ15262 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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PTPRKQ15262 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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PTPRKQ15262 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRKQ15262 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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