Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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