Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
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