Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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